1888年冬，光绪十四年十二月初四，李金镛率领僚佐、勇役、矿丁千人再次抵达漠河，开办金矿局，李金镛任金矿局总办。

漠河金厂自创立之初，就是仿照西方资本主义国家的做法，通过股份公司的形式，按照近代企业的要求，进行生产经营管理的。它以招商集股的方式筹集资金；在生产中使用机器、聘请外国矿师；设局统筹矿务，聘用管理人员，择优录用，从优褒奖；雇佣工人，给付工资；预计盈亏，余利分配。也正因如此，漠河金矿仅仅用了两年多的时间，就成为一个有相当规模、黄金产量达几万两的近代金矿企业。

自1888至1890年两年间，漠河金矿局设漠河金厂、奇乾河金厂、洛古河金厂和奇乾河西北沟金厂。1890年后又增设了瑷珲达音河金厂、洼希利沟金厂和观音山金厂等。设有漠河、二道盘、一间房、乾墨中站、漠口、黑河6个盘查局。

建起了上海、天津、烟台、营口、吉林、奉天、望奎、松花江口、瑷珲9个分局。采金地域上至洼希利沟，下至观音山，沿江4000里，人员达数万之众。

在薪金待遇上，认为“漠河一带千余里无人烟，艰险劳苦胜于内地十倍，且开办金厂，既藉以防边，又可抽助军饷，二者均关军国大事，非破格奖励，实不足昭激劝也”，主张从优抚恤。

在“将运粮、购器、建屋、设局、招兵勇、募矿丁，一切应行之事逐加办理”后，1889年1月14日，即光绪十四年十二月十三日，漠河金矿祭山开工。李金镛拟定了《开办漠河金厂章程十条》，成为矿务管理的规章制度。

又从上海、杭州等地招募了一大批妓女，满足金矿工人性需求。当时胭脂沟共有妓院百余家，俨然成为清朝末年我国规模最大的“红灯区”，其中日本妓院27家，俄国妓院24家，中国妓院66家，且随金点绵延百里，青楼随处可见。

李金镛在主持开矿的同时，还带领矿工试种蔬菜、土豆、麦类，取得了可喜的收获。金矿局上下员司勇佚矿工，历尽千辛万苦，和大自然作不屈不挠的斗争，也克服了沙俄金匪的干扰破坏，把矿区扩展到奇乾河、瑷珲西山小东沟、达义河、乌玛河、观音山、都鲁河等处，沿江上下，金矿相继开办。“年产金量从1889年的18961两增加到1895年的50742两，而企业结余也在不断增长，最高时达到677575两，股票也从初创时的293股涨到1894年的1022股”其产金量和结余的增多以及商股的大幅度增加就是明证。1892年，李鸿章说：“开办三年来，先后出金沙62000余两，除陆续分给股商官利外，所有勇夫饷械、粮运及各局经费，均由该厂筹给，不费公家之款。并提存余利，解充黑龙江军饷，以申报效。实属办理得法，成效昭彰”减轻了清廷的军费负担，达到了其“杜防边患，息外邦觊觎之心，弥内地奸民之隐”的意图。

后经朝廷批准，漠河金矿局改称“漠河金矿总局”，管辖黑龙江沿岸所有金厂。1889年，漠河金矿总局产金1.9万余两。

到1892年，即光绪十八年，“上至奇乾河，下至瑷珲，沿江两千余里，员弁丁夫，来往不绝。所募护矿营勇，训练精壮，沿边卡伦，声势联络，与黑龙江北岸俄城隐然对抗。外以折强邻窥伺之渐，内以立百年富庶之基，其有益于国计民生，殊非浅鲜”兴利实边，初见成效。

漠河金矿局是当时筹边政策的产物，在“借矿实边”思想指导下，一方面招回流民开矿，增加收入，以杜绝外人窥伺，另一方面又用金矿收入，募练护矿营，与防营、卡伦一起保护北疆边防。

虽然在半封建半殖民地状态下的中国，开办金矿有它自身的种种问题难以解决，而且俄人依然“伺隙抵瑕，意殊叵测”。但额尔古纳北部原始林区的开发，毕竟由此开始了，并且日益呈现新的面貌。

一时间繁荣起来的北疆，也吸引了商人的目光，纷纷来此经商。宋小濂在《北徼纪游》中感叹，“时不过二年，骤能如此其盛，若沿边一带，矿务渐次开拓，商务即可渐次腾茂，星罗棋布。边境虽虚，何尝不可借开矿招商而实之哉。”

1890年9月17日，即光绪十六年八月初四日，李金镛在任上病故，终年五十六岁。清廷对李金镛“照军营立功后积劳病故例从优议恤”。